CPAN Testers Reports: Reports for Bio-Das-Lite http://static.cpantesters.org/distro/B/Bio-Das-Lite.html を、みてみると、linuxは1.*しかとおってないのかな。httpステータスコードを見てみたら302が返ってきていた。 # $VAR1 = { # 'http://www.ensem…
http://twitter.com/biopython Thanks /Peterの人に教えてもらって、コマンドを追加して(clustalw, embossなど)、LANG=C にしたら、failが1まで減った。同じコマンドだが、LANGによって、test結果が違う。 LANG fail C 1 ja_JP.UTF-8 6 export LANG=C Ran 14…
実効結果 Result: FAIL Failed 3/331 test programs. 2/20974 subtests failed. tar jvfz BioPerl-1.6.1.tar.bz2 cd BioPerl-1.6.1 perl Build.PL ./Build test blib/script/bp_sreformat.PLS -> blib/script/bp_sreformat.pl blib/script/seqconvert.PLS ->…
コマンドがみつからないとかあるのかぁ実効結果 Ran 144 tests in 254.850 secondsFAILED (failures = 10) tar zxvf biopython-1.54.tar.gz cd biopython-1.54 python setup.py build python setup.py test running test test_Ace ... ok test_AlignIO ... o…
実効結果。 BUILD SUCCESSFUL unzip biojava-1.7.1-all.jar cd biojava-1.7.1 ant ant runtests Buildfile: /home/hogehoge/work/biojava/1.7.1_stable/biojava-1.7.1/build.xmlinit: [echo] Building biojava-1.7.1 [echo] Java Home: /usr/lib/jvm/java-6-…
slaveを追加するときに、マシンごとのMAVEN_HOMEを設定したいとき。 ノードの設定画面で [ツール]を押して、[maven]を選択し そのマシンのMAVEN_HOME(M2_HOME)を設定する。
m2eclipse m2eclipse: Installing m2eclipse http://m2eclipse.sonatype.org/installing-m2eclipse.html update site http://m2eclipse.sonatype.org/sites/m2em2eclipse extras http://m2eclipse.sonatype.org/sites/m2e-extras subversive Eclipse Subvers…
hudsonでテスト結果集計したいので、junit形式の結果出力するテストランナー あるのかなぁとおもったんだけど、パッとみつけられず。cucumberにはjunit形式で出力するオプションがあるようなんだけど、、、Customizing the Ruby TestRunner « End of Line ht…
googleのデータストアからデータがとれるとして、 新しく必要だったのはハンドラー。チュートリアルだと、MyPluginにあたるとこ。http://www.biojava.org/wiki/Dazzle:writepluginまずは、チュートリアルどおりにMyPluginを作ってみて動くことを確認。 多少…
http://wstestgae.appspot.com/das/dsn本家にあるチュートリアルを参考に作ってみた。 本家との違いは、cssとかxslとかかまされてるので、まぁdazzleのサイトだなってかんじの見た目になっているところかな。自分も、googleにdataをいれれるようにしたいなぁ…
sun-java-6と、eclipse.orgから落としたeclipse 3.5を使っているが、 どうも、マウスのボタンクリックがうまくいかない。とりあえずは、まず左クリックして、次にenterキーを押してみると、先に進む感じ。設定の問題かなぁ。最近まで、javaアプリがもっぱら…
debian ?? の /bin/sh が dash をみるようになっていたため、bashを期待して作ったスクリプトが動かなくなっていた。http://d.hatena.ne.jp/wadap/20090110/1231553066 を参考に dpkg-reconfigure dash で修正、再起動 /bin/shがbashみるようになっているこ…
notestが使えないなぁと思って調べてみたら、最近かわっていたようで。dh-make-perl: (No) support for the DEB_BUILD_OPTIONS ‘nocheck’. http://bugs.debian.org/cgi-bin/bugreport.cgi?bug=523560次のようにしたらパッケージはできた DEB_BUILD_OPTIONS=n…
dh-make-perl --cpan XML::Liberal --buildtestがうまく通ってないようだなぁ。 なにか足りないのかなぁ notestで作ってしまうかdh-make-perlが展開したディレクトリにおりて、 make testしてもやはり下のような同じエラーがでているなぁ PERL_DL_NONLAZY=1 …
Eclipseのpython開発用PyDev http://pydev.sf.net/updatesEclipseのgitプラグインであるegitのupdate http://www.jgit.org/update-siteEclipseのyaml editプラグイン http://grupy.net/yamlEditor/
新しい環境にplaggerをいれようとして次のエラーで止まってしまった Bareword "use_test_base" not allowed while "strict subs"このエラーがでた FAQにかいてあるのだが http://plagger.org/trac/wiki/PlaggerFAQ YAML, Module::Installl, Test::Baseが必要…
m-a prepare m-a a-i nvidia modprobe nvidia2.6.29で180.29-1はどうもコンパイルできないな。。。 asm/semaphore.hが解決できないようだが。。。
ログを読めばすぐ分かったがしばしはまったのでメモlibgcj-commonはじめgcjっぽいものがごそっとぬけたらきちんと起動した。
hudson git pluginをいれてみた。 チェックアウトまではスムーズで、 Repository urlにローカルのディレクトリを書いたらうまくいったかんじ。ただ、tagをうつところで、nameとかがないとエラーがでていた。 /var/lib/hudson/.gitconfig を新たに作って次の…
Hudsonの管理(/manage) プラグインの管理(/pluginManager) 利用可能(/pluginManager/available) インストールしたいプラグインをチェックして 「インストール」を押せばよい。
インストール方法などは MySQL Sandbox - MySQL Forge Wiki http://forge.mysql.com/wiki/MySQL_Sandbox 1. download the sandbox package and expand it somewhere; 2. download a MySQL binary tarball; 3. run this command MySQL Sandbox in Launchpad h…
Invalid --pidfile argument: '/var/run/hudson.pid' (Parent directory is not writable) 調べてみたら、/etc/default/hudsonでの PIDFILEの指定が 1.236から PIDFILE=/var/run/hudson.pid となっていたので、ここを1.235を参考に PIDFILE=/var/run/hudson/…
設定ファイルを指定する方法について備忘録。 ツール＞アドオン＞Flash Tracer だと「設定」が選択できないので、 ツール＞Flash Tracer とかでとりあえずサイドバーにだして、下のほうにある設定を選ぶ
dh-make-perl --cpan Acme::Lou --buildをしたらテストが通らなかったので、ちと調べてみた。mecabをインストールして、辞書もとりあえずutf-8 のをいれた。Acme::Louのデフォルトのエンコードも utf-8 にしたら、今までまったく変換されなかったのが 結構変…
新しい環境にいれてみたら、yankしてquitができなかったので(emacs22だから？) kill-summary-mode-mapに追加してみた (autoload 'kill-summary "kill-summary" nil t) (define-key global-map "\ey" 'kill-summary) (require 'kill-summary) (define-key kil…
Filter::Louを参考に作ってみた。 utf8::encode($str); がないとどうもいかないようだった。 package Plagger::Plugin::Filter::HTMLFeature; use strict; use base qw( Plagger::Plugin ); use utf8; use HTML::Feature; sub register { my ($self, $contex…
以前に話を聞く機会があって、いつかいれたいとおもってたのを試してみる。20100501追記 現在は、ここにインストールの方法が書いてある。 キーの登録とかも書いてあるので便利 http://hudson-ci.org/debian/ でもよくみたら、置いてあるバージョンが1.352ま…
Firefox Tip: Set Backspace's Firefox behavior - Lifehacker http://lifehacker.com/software/firefox-tip/set-backspaces-firefox-behavior-269945.phpしらなかった。かなりつかいづらかったのだけど、keyconfigってやつでなんとかその場をしのいでいたが…
タイトルをいれるところを title => $args->{feed}->title, こんなかんじに title => $args->{feed}->{title}->data,
webadmin accountmanager あたりの設定plugins/にいれたのち [components] trac.web.auth.LoginModule = disabled acct_mgr.web_ui.LoginModule = enabled webadmin.* = enabled [account-manager] password_format = htpasswd password_store = HtPasswdSto…
