biopython

biopython1.55beta をテストしてみる

dnalがない状態でテストを実行してみた。 biopython-1.55b% dnal zsh: command not found: dnalLANG=C なら問題なかった running test test_Ace ... ok test_AlignIO ... ok test_AlignIO_convert ... ok test_BioSQL ... /home/manabu/work/biopython/1.55b…

biopython 1.54 テストを動かした。その2

http://twitter.com/biopython Thanks /Peterの人に教えてもらって、コマンドを追加して(clustalw, embossなど)、LANG=C にしたら、failが1まで減った。同じコマンドだが、LANGによって、test結果が違う。 LANG fail C 1 ja_JP.UTF-8 6 export LANG=C Ran 14…

biopython 1.54 のテストを動かしてみた

コマンドがみつからないとかあるのかぁ実効結果 Ran 144 tests in 254.850 secondsFAILED (failures = 10) tar zxvf biopython-1.54.tar.gz cd biopython-1.54 python setup.py build python setup.py test running test test_Ace ... ok test_AlignIO ... o…