2010-06-01から1ヶ月間の記事一覧

biopython 1.54 テストを動かした。その2

http://twitter.com/biopython Thanks /Peterの人に教えてもらって、コマンドを追加して(clustalw, embossなど)、LANG=C にしたら、failが1まで減った。同じコマンドだが、LANGによって、test結果が違う。 LANG fail C 1 ja_JP.UTF-8 6 export LANG=C Ran 14…

bioperl 1.6.1 のテストを動かしてみた

実効結果 Result: FAIL Failed 3/331 test programs. 2/20974 subtests failed. tar jvfz BioPerl-1.6.1.tar.bz2 cd BioPerl-1.6.1 perl Build.PL ./Build test blib/script/bp_sreformat.PLS -> blib/script/bp_sreformat.pl blib/script/seqconvert.PLS ->…

biopython 1.54 のテストを動かしてみた

コマンドがみつからないとかあるのかぁ実効結果 Ran 144 tests in 254.850 secondsFAILED (failures = 10) tar zxvf biopython-1.54.tar.gz cd biopython-1.54 python setup.py build python setup.py test running test test_Ace ... ok test_AlignIO ... o…

biojava 1.7.1 のテストを動かしてみた

実効結果。 BUILD SUCCESSFUL unzip biojava-1.7.1-all.jar cd biojava-1.7.1 ant ant runtests Buildfile: /home/hogehoge/work/biojava/1.7.1_stable/biojava-1.7.1/build.xmlinit: [echo] Building biojava-1.7.1 [echo] Java Home: /usr/lib/jvm/java-6-…

slaveを追加するときのメモ。

slaveを追加するときに、マシンごとのMAVEN_HOMEを設定したいとき。 ノードの設定画面で [ツール]を押して、[maven]を選択し そのマシンのMAVEN_HOME(M2_HOME)を設定する。