Gbrowse 1.64をpublic_htmlの下にインストールしてみる
いろいろいじりたいので
こんなかなぁ
perl Makefile.PL APACHE=~/public_html/ggb164a NONROOT=1 BIN=~/public_html/ggb164a/bin LIB=~/public_html/ggb164a/lib
confをかきかえる
# Web site configuration info
stylesheet = /~hoge/ggb164a/htdocs/gbrowse/gbrowse.css
buttons = /~hoge/ggb164a/htdocs/gbrowse/images/buttons
js = /~hoge/ggb164a/htdocs/gbrowse/js
tmpimages = /tmp
で、このとき tmpimagesはdebianだと
/var/www/tmp
をさすので、ここを書き込めるようにしておくこと。。。
うーん、ここらも指定できたらいいのになぁ。。。
gbrowse_detailsをみたいなら
libのしたの
Bio/Graphics/Browser.pm
の2349行目のところを
#return "../../gbrowse_details/$data_source?name=$name;class=$class;ref=$ref;start=$start;end=$end"; return "./gbrowse_details/$data_source?name=$name;class=$class;ref=$ref;start=$start;end=$end";
こんなかんじにする
いまのところわかっているのはこれくらい